Abrimos blender y si no tenemos el cubo, pues lo creamos Add>Mesh>Cube

Seleccionamos el cubo y en Edit Mode lo subdividimos dos veces W>Subdivide W>Subdivide

Ahora con el cubo seleccionado presionamos F7 y el botón Physics Button

y en la ventana Soft Body presionamos sobre el botón Enabled Soft Body e introducimos los siguientes valores

También le añadiremos una Deflection

Ahora vamos a colocar un empty en el centro del cubo. Para ello primero vamos a colocar el cursor en el centro del cubo. Presionamos Shift+S y la opción Cursor->Selection  y luego el empty con Add>Empty

A este empty le vamos a dar una fuerza de tipo esférica, para ello en la ventana Fields and Deflection seleccionamos la opción Spherical, presionamos el botón Use MaxDist y le ponemos los valores de la imagen

Ahora viene la parte más pesada, tenemos que separar todos los lados del cubo, para hacerlo más fácil vamos a cambiar a la opción Modo Selección de Lados y los tenemos que ir separando uno por uno, con la opción P

Una vez  tenemos todos los lados independientes, solo tenemos que presionar Alt+A para ver el efecto.